孕酮低一般指的是怀孕孕酮低，怀孕孕酮低肚子一阵一阵的疼可能是先兆流产、异位妊娠、黄体功能不全等原因引起，应针对情况采取处理措施。

1、先兆流产：先兆流产的发生和多种因素都有关系，比如胚胎因素、母体因素、环境因素等，由于分泌的孕激素不足，所以会导致怀孕孕酮低肚子一阵一阵的疼。一般要在医生的指导下及时口服补充孕酮的药物治疗，比如黄体酮胶囊、地屈孕酮片等，保胎期间还需要卧床休息，不可随意走动。

2、异位妊娠：异位妊娠是指受精卵在子宫以外的部位着床，其发生和输卵管炎、输卵管发育不良、避孕失败等有关，由于异位妊娠的胚胎孕酮水平会比较低，所以也会出现怀孕孕酮低肚子一阵一阵的疼。一旦确诊，需要采取相应的终止妊娠措施，比如腹腔镜手术、开腹手术等。

3、黄体功能不全：女性怀孕后由于黄体功能不足，导致卵巢分泌的孕激素不足，所以会出现怀孕孕酮低肚子一阵一阵的疼，目前的发病原因并不是特别的明确，可能和子宫内膜上的孕激素受体异常、子宫内膜接受功能不良等原因有关。一般可以口服药物治疗，比如黄体酮胶囊、地屈孕酮片等，治疗期间要合理的安排睡眠时间，避免过度劳累。

怀孕孕酮低肚子一阵一阵的疼，服用药物治疗期间需要严格遵照医嘱使用，不可私自购买，以防产生不良影响。