在江苏扬州，有多家医院在治疗真菌性巩膜炎方面具有较高的声誉和专业水平。以下是根据搜索结果整理的扬州地区治疗真菌性巩膜炎较好的医院排名：

扬州大学附属医院

• 评级：三甲
• 特色：集医疗、教学、科研、急救、预防、康复为一体，设有多个硕士点。
• 地址：东区：扬州市泰州路45号；西区：扬州市邗江中路368号
• 联系方式：0514-82981199(总机)

扬州市第一人民医院

• 评级：三甲
• 特色：东南大学医学院附属扬州医院，扬州大学第二临床医学院，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
• 地址：东区：扬州市泰州路45号；西区：扬州市邗江中路368号
• 联系方式：0514-82981199(总机)

江苏省苏北人民医院

• 评级：三甲
• 特色：扬州大学附属苏北人民医院，医疗设施齐全，治疗经验丰富。
• 地址：江苏省扬州市江都区东方红路9号
• 联系方式：0514-86536691
• 专家评论：在治疗真菌性皮肤病方面有着丰富的经验。

以上医院均为扬州地区在治疗真菌性巩膜炎方面表现突出的医疗机构，但具体治疗效果还需根据患者个体情况而定。建议患者在选择医院时，结合自身病情、医院专业水平、地理位置等多方面因素进行综合考虑，并可咨询专业医生的意见。