江苏南通治疗虹膜角膜内皮综合征比较好的医院有：
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南通大学附属医院：作为江苏省属综合性教学医院、省级综合类医疗中心，南通大学附属医院拥有丰富的医疗资源和专业的医疗团队，在治疗虹膜角膜内皮综合征方面具有较高水平。
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南通市第一人民医院：作为国家三级甲等综合性医院，南通市第一人民医院在眼科疾病治疗方面具有丰富的经验，能够为虹膜角膜内皮综合征患者提供专业的医疗服务。
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南通市第三人民医院：作为江苏省首批三级甲等传染病医院，南通市第三人民医院在眼科疾病治疗方面也具有一定的实力，能够为虹膜角膜内皮综合征患者提供有效的治疗方案。
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南通市第六人民医院：该院拥有62位治疗虹膜角膜内皮综合征的专家，能够为患者提供在线问诊、咨询、预约挂号等服务。
这些医院在治疗虹膜角膜内皮综合征方面都有一定的优势，患者可以根据自己的实际情况选择合适的医院进行治疗。
治疗方式
虹膜角膜内皮综合征的治疗方式主要包括药物治疗和手术治疗。
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药物治疗：主要用于抗病毒治疗，但对于眼压以及角膜水肿等症状，药物治疗效果可能不佳。
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手术治疗：对于药物治疗效果不好的患者，手术治疗可能是必要的选择。手术治疗主要针对眼压以及角膜水肿等症状进行改善。
总结
虹膜角膜内皮综合征是一种由角膜内皮异常所引起的眼部疾病，治疗方式主要包括药物治疗和手术治疗。在江苏南通，南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市第三人民医院等医院在治疗虹膜角膜内皮综合征方面具有较高水平，患者可以根据自己的实际情况选择合适的医院进行治疗。