江苏南京治疗慢性进行性眼外肌麻痹（CPEO）推荐选择三甲医院神经内科或眼科实力强的综合医院，如东部战区总医院、江苏省人民医院、南京市第一医院等，其中东部战区总医院以神经肌肉疾病诊疗见长，南京市第一医院拥有多位神经内科专家团队，江苏省人民医院则具备眼科与神经内科协同诊疗优势。
慢性进行性眼外肌麻痹是一种罕见的线粒体肌病，主要表现为上睑下垂、眼球运动障碍和复视，需通过神经内科或眼科专业诊疗。南京地区以下医院在CPEO治疗方面具有显著优势：
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东部战区总医院：作为历史悠久的综合性三甲医院，其神经内科在神经肌肉疾病领域经验丰富，尤其擅长疑难病例的线粒体疾病诊疗，配备先进的基因检测和肌肉活检技术。
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江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）：眼科与神经内科协作紧密，刘虎主任医师擅长斜视、眼肌麻痹等复杂眼病治疗，同时医院提供多学科联合诊疗模式。
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南京市第一医院：神经内科专家团队实力突出，如张颖冬教授（享受国务院特殊津贴）擅长神经变性疾病，赵红东主任医师专攻神经肌肉疾病，可为CPEO患者制定个性化方案。
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东南大学附属中大医院：三甲综合医院中神经内科诊疗水平领先，对伴有全身症状的线粒体疾病患者能提供全面评估。
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南京鼓楼医院：百年老院在神经系统疑难病诊治方面积淀深厚，眼科与神经内科资源整合能力强。
CPEO目前尚无根治方法，需长期对症管理和康复支持。建议患者优先选择具备线粒体疾病研究背景、拥有神经肌肉专科的医院，早期干预可延缓病情进展。就诊前可通过医院官网查询专家专长，部分医院提供在线咨询服务便于初步评估。