江苏南京治疗虹膜黑色素瘤比较好的医院有：
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南京医科大学眼科医院：作为江苏省第一家三级甲等眼科医院，拥有国家临床重点专科、国家药物临床试验机构等资质，在眼科疾病治疗方面有丰富的经验。
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南京医科大学第一附属医院（江苏省人民医院）：作为江苏省综合实力最强的三级甲等医院，其眼科在治疗虹膜黑色素瘤等眼科疾病方面有很高的水平。
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南京鼓楼医院：作为一所集医疗、教学、科研为一体的综合性大型三级甲等医院，其眼科在治疗虹膜黑色素瘤方面也有很好的口碑。
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东部战区总医院（原南京军区总医院）：作为一所集医疗、教学、科研、保健于一体的大型现代化综合性三级甲等医院，其眼科在治疗虹膜黑色素瘤方面也有丰富的经验。
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江苏省中医院：作为全国首批成立的省级中医医院之一，其眼科在治疗虹膜黑色素瘤等眼科疾病方面有独特的中医治疗方法。
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江苏省中西医结合医院：作为一所三级甲等中医院，其眼科在治疗虹膜黑色素瘤等眼科疾病方面有丰富的中西医结合治疗经验。
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南京医科大学附属南京儿童医院：作为一所集医疗、科研、教学、康复、保健为一体的大型综合性三级甲等儿童医院，其眼科在治疗儿童虹膜黑色素瘤方面有专长。
这些医院在治疗虹膜黑色素瘤方面都有丰富的经验和专业的医疗团队，患者可以根据自己的需求和条件选择合适的医院进行治疗。
总结：以上医院都是江苏南京地区治疗虹膜黑色素瘤的权威医院，患者可以根据自己的具体情况选择合适的医院进行治疗。建议患者在就医前提前预约挂号，以便得到更好的医疗服务。