内蒙古通辽治疗小儿眼外肌麻痹-视网膜色素变性-心脏传导阻滞综合征的医院排名中，综合实力较强的医院包括通辽市医院、内蒙古民族大学附属医院、通辽市科尔沁区第一人民医院等。这些医院在眼科、儿科、心血管专科等领域具备三甲资质或特色诊疗技术，尤其通辽市医院作为全市最大的综合性三甲医院，在视网膜色素变性和心脏传导阻滞的跨学科治疗上经验丰富；内蒙古民族大学附属医院则以蒙西医结合为特色，在疑难杂症诊疗中具有独特优势。
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通辽市医院：作为通辽市唯一的三甲综合医院，其眼科、儿科和心内科均为市级重点学科，拥有先进的视网膜色素变性诊断设备（如OCT、高清眼底造影系统）和心脏介入技术，可开展多学科联合诊疗。医院设有51个临床科室，覆盖小儿眼外肌麻痹的神经电生理检查、心脏传导阻滞的起搏器植入等复杂治疗。
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内蒙古民族大学附属医院：三甲蒙西医结合医院，其蒙医传统疗术科为自治区重点学科，擅长通过蒙药、针灸等特色疗法辅助治疗小儿神经系统疾病和代谢性疾病。眼科配备超声乳化仪等设备，对遗传性视网膜病变有研究经验，且与吉林大学中日联谊医院建立合作，可开展远程会诊。
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通辽市科尔沁区第一人民医院：三级综合医院，眼科和儿科为优势科室，拥有标准化手术室和ICU，可处理小儿眼外肌麻痹的矫正手术。与通辽市肿瘤医院资源整合后，在遗传性疾病的多学科管理上更具协同性。
提示：该综合征属罕见病，建议优先选择具备遗传病专科或儿童疑难病会诊中心的医院，并提前预约专家号。部分医院需通过蒙医特色门诊挂号，就诊前可咨询医院官网或电话确认。