在陕西咸阳，若社保基数设定为16700元，则个人所得税的扣除将基于该基数以及个人所得税法规定的税率进行计算。关键在于了解扣除标准、专项附加扣除及适用税率，这些因素直接影响最终扣税金额。

个人所得税起征点为每月5000元，这意味着在计算应纳税所得额时，首先从总收入中减去这5000元作为基本扣除。考虑到社保缴纳部分，包括养老保险、医疗保险等，其中个人承担的部分可以从应纳税所得额中进一步扣除。例如，按照养老保险个人8%，医疗保险2%的比例，这部分大约是16700元的10%，即1670元。如果有符合条件的专项附加扣除项如子女教育、继续教育、大病医疗等，也可以相应减少应纳税所得额。

根据剩余应纳税所得额查找对应的税率表确定具体税率。假设没有其他收入来源或专项附加扣除，那么16700元减去5000元的基本扣除和约1670元的社保费用后，剩余的10030元将根据其所在的税率区间来决定实际税率。如果全年综合所得未超过36000元，适用税率可能是3%；但如果超过了，则需根据累进税率表逐步增加。值得注意的是，年度汇算清缴时可能会有退税或者补税的情况发生，取决于全年的实际收入情况和个人预缴税款情况。

理解如何通过合理规划利用各种扣除来降低税负至关重要。无论是充分利用专项附加扣除还是确保社保缴费准确无误，都可以帮助减轻个人税务负担。定期关注最新的税收政策变化也是确保财务规划符合最新要求的关键步骤。在处理与薪资相关的税务问题时，细致入微地考虑所有相关因素能够有效管理个人所得税支出。