根据权威信息源综合分析，南京在心脏疾病诊疗方面表现突出的医院如下：
一、综合推荐
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南京市第一医院
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优势 ：心血管内科为国家级医学重点学科，擅长复杂心脏手术（如先天性心脏病、主动脉瘤修复、心脏移植等），技术力量雄厚。
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特色 ：拥有7个病区、293张床位，年门诊量达26万人次，介入治疗经验丰富。
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东南大学附属中大医院
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优势 ：心血管内科是江苏省临床重点专科，在心脏起搏和电生理治疗方面具有独特技术优势。
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特色 ：综合实力强，能处理冠心病、心律失常等复杂疾病。
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南京大学医学院附属鼓楼医院
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优势 ：心血管内科为国家重点科室，介入治疗技术成熟，设备先进。
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特色 ：综合诊疗能力强，适合常规心血管疾病及介入手术。
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江苏省人民医院
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优势 ：心血管内科华东区域排名靠前，处理复杂疾病能力强，团队经验丰富。
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特色 ：综合医疗资源丰富，适合多学科协作治疗。
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二、选择建议
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介入治疗 ：优先考虑鼓楼医院、第一医院或中大医院，设备与技术成熟。
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复杂手术 ：南京市第一医院在先天性心脏病、心脏移植等方面更具优势。
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综合康复 ：中大医院在心脏起搏与电生理治疗上技术突出。
建议根据具体疾病类型及需求，结合医院专科优势选择。