肠壁水肿增厚需明确病因后针对性治疗，感染性炎症可用抗生素，免疫相关疾病或需抗炎免疫调节，肿瘤性病变可能需手术，日常注意饮食调理。
处理肠壁水肿增厚应先通过检查确诊病因，因治疗方法因病因而异。
- 控制感染：若由细菌、病毒等微生物感染引起肠炎，导致肠壁水肿增厚，可在医生指导下使用抗生素（如头孢类、庆大霉素等）或抗病毒药物清除病原体。
- 调节免疫：针对系统性疾病引发的肠壁病变，如硬皮病、系统性红斑狼疮等，可能需要使用非甾体抗炎药、糖皮质激素（如泼尼松）或免疫抑制剂（如硫唑嘌呤），抑制免疫反应、减轻炎症损伤。
- 肿瘤干预：若肠壁增厚与息肉、腺瘤甚至恶性肿瘤相关，可能需要内镜下切除息肉或通过外科手术根治，恶性肿瘤还需术后结合放化疗降低复发风险。
- 缓解症状：伴随腹痛、腹泻时，可遵医嘱使用解痉药、止泻剂（如蒙脱石散），若肠梗阻导致水肿需减压处理，严重时可能需手术解除梗阻。
- 生活方式调整：减少高脂高糖、辛辣刺激性食物摄入，增加膳食纤维摄取，避免肠道负担过重；慢性患者注意劳逸结合，减少体力活动或选择易消化饮食。
肠壁水肿增厚并非独立疾病，需结合影像学、病理学等综合判断病因，务必在医生指导下规范治疗，避免自行用药延误病情。