云南临沧社保基数21600元和5000元的主要区别体现在以下方面：
缴费金额
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社保基数21600元：
- 每月个人需缴纳约432元（养老保险168元+医疗保险54元+失业保险20.4元）。
- 单位合计缴纳约1080元（养老保险336元+医疗保险168元+失业保险54元+工伤保险16.8元+生育保险9.6元）。
- 总缴费约1512元/月。
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社保基数5000元：
- 每月个人需缴纳社保费用约525元（养老保险8%+医疗保险2%+失业保险0.5%）。
- 工伤保险和生育保险由单位承担，个人无需缴费。
缴费比例
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社保基数21600元：
- 养老保险：个人按基数8%缴纳。
- 医疗保险：个人缴费比例为3%。
- 失业保险：个人0.3%。
- 工伤保险：单位0.2%-1.9%。
- 生育保险：单位全额承担。
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社保基数5000元：
- 养老保险：个人缴纳8%（400元）。
- 医疗保险：个人缴纳2%（100元）。
- 失业保险：个人缴纳0.5%（25元）。
缴费档次
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社保基数21600元：
- 属于较高的缴费档次，具体档次需根据当地政策确定。
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社保基数5000元：
- 通常对应的是第二档缴费标准，代表了职工的社保缴费基数处于一个中等水平。
对个人所得税的影响
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社保基数21600元：
- 具体对个人所得税的影响需根据当年收入水平和个税起征点计算。
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社保基数5000元：
- 扣除社保后的月收入4475元低于个税起征点5000元，因此无需缴纳个人所得税。
请注意，以上内容仅供参考，具体的缴费金额和比例可能会因政策调整而有所变化，建议通过官方渠道查询最新信息。