根据2025年最新政策，新农合住院报销比例因医疗机构级别和费用区间而有所不同，具体如下：
一、总体报销比例
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一级医疗机构（乡镇卫生院）
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报销比例：60%
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起付线：100元（100元内不报销）
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分段报销：
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300元以下：30%
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300-2000元：70%
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2000元以上：50%
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二级医疗机构（县级医院）
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报销比例：40%
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起付线：500元（500元内不报销）
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分段报销：
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5000元以下：50%
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5000-10000元：55%
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10000元以上：60%
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三级医疗机构（市级及以上医院）
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报销比例：30%
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起付线：700元（700元内不报销）
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分段报销：
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5000元以下：35%
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5000-10000元：40%
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10000元以上：45%
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二、其他注意事项
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大病报销 ：门诊慢特病患者不设起付线，按70%报销；住院费用超过起付线后，各级医疗机构补助比例分别提高至55%-80%。
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封顶线 ：每年累计最高报销4万元。
以上信息综合自2025年最新政策文件，具体执行可能因地区略有差异，建议咨询当地医保部门。