菏泽市农村合作医疗报销比例根据就诊级别和费用类型有所不同，具体如下：
一、门诊报销比例
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村卫生室/中心卫生室
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报销比例：60%
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限制：处方药费单次限额10元。
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镇卫生院
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报销比例：40%
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限制：检查费/手术费单次限额50元，处方药费单次限额100元。
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二级及以上医院
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报销比例：30%（二级）、20%（三级）
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限制：检查费/手术费单次限额50元，处方药费单次限额200元。
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二、住院报销比例
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一级医疗机构（镇卫生院等）
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报销比例：65%
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起付线：100元（60岁以上老人每日10元，限额200元）。
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二级医疗机构
- 报销比例：50%（5000元以下）+ 55%（5000-10000元）+ 60%（10000元以上）。
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三级医疗机构
- 报销比例：35%（5000元以下）+ 40%（5000-10000元）+ 45%（10000元以上）。
三、大病报销政策
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门诊大病 ：乡、村补助比例65%、75%。
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住院大病 ：累计费用超过5000元后分段报销，5001-10000元65%、10001-18000元70%。
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特定病种 ：如尿毒症、白血病等8种大病定额报销70%。
四、其他说明
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起付线与封顶线 ：住院起付线一级100元，三级无起付线；年度封顶线4万元。
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门诊补偿年限 ：镇级合作医疗门诊补偿总额每年最高5000元。
以上信息综合自2025年最新政策文件及权威渠道，具体执行以当年医保部门规定为准。