海南琼中社保基数20900元和5000元在多个方面存在显著区别，主要体现在缴费金额、社保待遇和适用人群等方面。

缴费金额差异

• 20900元基数：个人和单位需按更高比例缴纳社保费用。例如，养老保险单位缴纳约16%（3344元），个人缴纳8%（1672元）。医疗保险单位缴纳约8.5%（173.4元），个人缴纳2%（101.6元）。失业保险单位缴纳约0.5%（104.5元），个人缴纳0.5%（104.5元）。
• 5000元基数：缴费总额较低，养老保险单位缴纳约800元，个人缴纳400元，经济压力更小。

社保待遇差别

• 养老金：高基数者退休后领取的养老金明显更高，因个人账户和统筹账户积累更多。
• 医疗报销：医保个人账户划入金额与基数挂钩，20900元基数下每月医保卡到账更多，可支配医疗资源更充裕。
• 失业/工伤待遇：高基数者的失业金、工伤补偿等均按更高标准计算。
• 生育保险：职工个人不缴纳，企业以职工工资为基数缴纳，基数20900时企业缴纳金额更多，女职工享受的生育津贴等福利计算也可能与缴费基数挂钩。

适用人群不同

• 20900元基数：适合收入远超社会平均工资的群体，如企业高管、高薪技术人员等，追求更高保障水平。
• 5000元基数：常见于普通工薪阶层或灵活就业人员，更注重当前经济负担的合理性。

总的来说，选择社保基数时需权衡短期经济压力与长期福利，建议根据实际收入和对保障的需求合理选择。高基数长期收益更优，但需确保持续缴费能力；低基数则适合预算有限但需基础保障的人群。