海南澄迈县社保基数12900元和5000元的区别主要体现在缴费金额、个人账户积累、养老金待遇以及社保待遇等方面，具体区别如下：
缴费金额
- 社保基数12900元：
- 每月个人缴纳费用约为：1032元（12900元 × 8%）。
- 每月公司缴纳费用约为：1032元（12900元 × 20%）。
- 社保基数5000元：
- 每月个人缴纳费用约为：400元（5000元 × 8%）。
- 每月公司缴纳费用约为：1000元（5000元 × 20%）。
个人账户积累
- 社保基数越高，每月划入个人账户的金额越多，长期来看，个人账户积累也会更多。选择12900元作为缴费基数，个人账户积累会相对较多。
养老金待遇
- 养老金的领取金额与个人的缴费基数和缴费年限密切相关。缴费基数越高，缴费年限越长，退休后领取的养老金也就越多。
社保待遇
- 社保待遇与社保缴费直接挂钩，尤其是养老保险和医疗保险。缴费基数越高，划入个人账户的金额越多，退休后所获得的养老金和医疗报销待遇也会更好。
总的来说，选择较高的社保缴费基数（如12900元）会导致个人和公司每月需要缴纳更多的社保费用，但个人账户积累更多，退休后领取的养老金和享受的社保待遇也会更好。相反，选择较低的缴费基数（如5000元），每月缴纳费用较少，但长期来看，个人账户积累和退休后的社保待遇会相对较低。请根据个人经济状况和需求，合理选择社保缴费基数。