海南文昌社保基数16900元和5000元的区别主要体现在缴费金额、社保待遇以及用人单位负担等方面，具体区别如下：
缴费金额
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社保缴费基数16900元：
- 养老保险：单位缴费金额为16900元 * 16% = 2704元，个人缴费金额为16900元 * 8% = 1352元。
- 医疗保险：单位缴费金额为16900元 * 8% = 1352元，个人缴费金额为16900元 * 2% = 338元。
- 失业保险：单位缴费金额为16900元 * 2% = 338元，个人缴费金额为16900元 * 1% = 169元。
- 工伤保险：单位缴费金额根据行业风险浮动，假设为1%，则单位缴费金额为16900元 * 1% = 169元。
- 生育保险：单位缴费金额为16900元 * 0.8% = 135.2元。
- 总计：单位每月缴费约为4361.2元，个人每月缴费约为2247.4元。
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社保缴费基数5000元：
- 养老保险：单位缴费金额为5000元 * 16% = 800元，个人缴费金额为5000元 * 8% = 400元。
- 医疗保险：单位缴费金额为5000元 * 6.5% = 325元，个人缴费金额为5000元 * 2% = 100元。
- 失业保险：单位缴费金额为5000元 * 0.5% = 25元，个人缴费金额为5000元 * 0.5% = 25元。
- 工伤保险：单位缴费金额根据行业风险浮动，假设为0.5%，则单位缴费金额为5000元 * 0.5% = 25元。
- 生育保险：单位缴费金额为5000元 * 0.8% = 40元。
- 总计：单位每月缴费约为1200元，个人每月缴费约为720元。
社保待遇
- 社保待遇与缴费基数直接挂钩：缴费基数越高，划入个人账户的余额就会越高，退休后所获得的养老金自然也会更多。从养老金角度来看，选择16900元作为缴费基数会获得更高的退休待遇。
用人单位负担
- 缴费基数过高会增加用人单位负担：对于用人单位来说，缴费基数过高会是不小的负担。从用人单位角度来看，选择较低的缴费基数（如5000元）可以减轻其负担。
总的来说，社保基数16900元相比5000元，每月单位和个人需要缴纳的金额更多，因此用人单位负担更重，但个人退休后可获得的养老金也更多。