海南文昌社保基数16400元扣税金额需根据实际应纳税所得额计算，关键影响因素包括：社保公积金个人缴纳部分（约17%-23%）、专项附加扣除（如子女教育等）及个税累进税率（3%-45%）。以全额基数缴纳社保且无附加扣除为例，月应纳税所得额约 *9000-11000元* ，对应税率10%-20%，预估个税约 *300-1500元* 。

1. 社保公积金扣除
   海南文昌社保基数16400元需按比例缴纳养老（8%）、医疗（2%）、失业（0.5%）及公积金（5%-12%），合计约17%-23%。以20%计算，个人每月缴纳约3280元，剩余13120元为计税工资。

2. 应纳税所得额计算
   个税起征点为5000元，扣除社保后剩余13120元中，再减去5000元基本减除费用及专项附加扣除（如有），得出应纳税所得额。若无附加扣除，则应纳税所得额为8120元。

3. 税率与速算扣除数
   根据个税累进税率表，8120元适用10%税率，速算扣除数210元，应缴个税为：

   $$8120 \times 10\% - 210 = 602\ 元$$

   若存在附加扣除（如2000元/月），应纳税所得额降至6120元，个税降至402元。

提示：实际扣税需结合个人社保缴纳比例、公积金浮动及附加扣除项，建议通过个税计算器或咨询当地税务部门精准核算。