在海南五指山，如果您的社保缴费基数设定为5000元，根据最新的社保政策，灵活就业人员的个人养老保险缴费比例为20%，这意味着每月需缴纳1000元用于养老保险。医疗保险等其他险种的缴费也将基于这一基数进行计算。

社保缴费基数直接影响到您每个月需要支付的社保费用。对于五指山的灵活就业人员来说，社保基数设为5000元时，养老保险是按照个人承担20%的比例来计算的，即每月需缴纳1000元。这不仅保障了未来的养老权益，也是法律规定的义务。

除了养老保险外，灵活就业者还可以选择参加医疗保险。虽然具体比例可能因地区而异，但通常情况下，医疗保险的个人缴费部分也会基于同样的基数进行计算。这意味着，在考虑养老保险的基础上，还需额外支付一定金额作为医疗保险费用，以确保基本医疗保障。

值得注意的是，尽管社保基数固定为5000元，但由于每年都会对社保基数上下限进行调整，因此实际缴费金额可能会有所变化。例如，随着社会平均工资水平的提高，下一年度的社保基数上限和下限也会上调，进而影响到具体的缴费数额。

选择不同的社保缴费档次也会影响最终的缴费金额。五指山提供的灵活就业社保缴费档次一般分为几个级别，从最低60%到最高300%不等。如果您选择了5000元作为缴费基数，这通常是对应于一个中等偏上的缴费档次，意味着未来可以享受到相对较高的养老金待遇。

考虑到社保的重要性及其对未来生活质量的影响，合理规划社保缴费是非常必要的。通过了解自己的经济状况和退休规划目标，选择最适合自己的缴费基数和档次，不仅能有效减轻当前的经济负担，还能确保退休后拥有稳定的收入来源。理解并正确应用社保基数与缴费比例的关系，对于每一位灵活就业者而言都是至关重要的。