广西来宾社保基数12400元和5000元的区别主要体现在缴费金额、缴费比例以及养老保险待遇等方面，具体如下：
缴费金额差异
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缴费基数12400元的情况：
- 假设按照广西来宾社保缴费基数下限4053.60元计算，若个人工资为12400元，则超出部分为8346.4元。
- 养老保险个人缴纳部分约为：8346.4元 × 8% = 667.71元。
- 企业缴纳部分约为：8346.4元 × 16% = 1335.42元。
- 医疗保险个人缴纳部分约为：8346.4元 × 2% = 166.93元。
- 企业缴纳部分约为：8346.4元 × 6.5% = 542.48元。
- 失业保险个人和企业缴纳部分均为：8346.4元 × 0.5% = 41.73元。
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缴费基数5000元的情况：
- 养老保险个人缴纳部分约为：5000元 × 8% = 400元。
- 企业缴纳部分约为：5000元 × 16% = 800元。
- 医疗保险个人缴纳部分约为：5000元 × 2% = 100元。
- 企业缴纳部分约为：5000元 × 6.5% = 325元。
- 失业保险个人和企业缴纳部分均为：5000元 × 0.5% = 25元。
缴费比例差异
- 养老保险：单位和个人缴费比例分别为8%和16%。
- 医疗保险：单位和个人缴费比例分别为2%和6.5%。
- 失业保险：单位和个人缴费比例均为0.5%。
- 工伤保险和生育保险：由单位全额承担。
养老保险待遇差异
- 缴费基数越高，个人账户积累越多，退休后领取的养老金也相应越多。具体养老金计算包括基础养老金和个人账户养老金两部分。
请注意，以上信息仅供参考，具体缴费金额和比例可能因政策调整而有所变化，建议咨询当地社保机构以获取最准确的信息。