在中山市，社保基数为6900元和5000元的主要区别体现在以下方面：
缴费金额
| 险种 | 基数为6900元 | 基数为5000元 |
|---|---|---|
| 养老保险 | 单位：1380元，个人：552元 | 单位：1000元，个人：400元 |
| 医疗保险 | 单位：552元，个人：138元 | 单位：400元，个人：100元 |
| 失业保险 | 单位：69元，个人：69元 | 单位：50元，个人：50元 |
| 工伤保险和生育保险 | 单位全额缴纳，费率根据行业风险类别不同 | 单位全额缴纳，费率为0.3% |
缴费比例
- 养老保险：单位和个人缴费比例分别为20%和8%。
- 医疗保险：单位和个人缴费比例分别为8%和2%。
- 失业保险：单位和个人缴费比例均为1%。
- 工伤保险和生育保险：由单位全额缴纳。
养老金计算
养老金的计算基于缴费基数、缴费年限和缴费比例。选择较高的缴费基数（如6900元）会导致个人账户积累更多的金额，从而在退休后领取更高的养老金。
总的来说，选择较高的社保缴费基数（如6900元）会导致每月缴费金额增加，但长期来看，个人账户积累更多，有助于退休后领取更高的养老金。而选择较低的缴费基数（如5000元），每月缴费金额较少，适合经济压力较大的人群。具体选择应根据个人经济状况、未来退休规划以及对退休生活的期望等因素综合考虑。