在广东珠海，选择16400元作为社保缴费基数相比选择5000元，主要区别在于个人和单位的缴费金额更高、未来养老金待遇更优厚以及对失业保险和工伤保险的影响不同。较高的缴费基数意味着更多的社保费用支出，但同时也带来了更高的社会保障水平。

• 养老保险：以16400元为基数缴纳，无论是个人还是单位，所需支付的养老保险费都将显著高于以5000元为基数的情况。这直接影响到退休后每月领取的养老金数额，通常情况下，基数越高，退休金越多。
• 医疗保险：同样地，较高基数会导致更高的医疗保险缴费，但是也意味着个人账户中的资金更多，在医疗报销方面可能享受更好的待遇。
• 失业保险与工伤保险：尽管这两项保险的缴费比例相对较低，但基数的不同仍然会影响具体的缴费金额。值得注意的是，工伤保险完全由单位承担，因此对于企业而言，高基数意味着更高的成本负担。
• 其他影响：除了上述直接经济上的差异外，选择不同的社保基数还可能影响到诸如购房资格审核、积分落户等政策条件的满足情况，特别是在一些大城市中，社保连续缴纳记录是重要的考量因素之一。

选择16400元作为社保缴费基数相较于5000元，虽然短期内会增加一定的经济压力，但从长远来看，可以享受到更为完善的社会保障体系，并且在退休后能够获得更加丰厚的养老待遇。对于那些希望在未来拥有更好生活保障的人来说，根据自身经济状况合理选择社保缴费基数是非常重要的。考虑到各地政策可能存在差异，建议关注当地最新政策动态以做出最适合自己的决策。