在江苏连云港，社保基数5600和5000的主要区别体现在以下方面：
缴费基数档次
- 5600元档次：连云港灵活就业社保缴费基数一般分为多个档次，具体为上年度在岗职工平均工资的60%、70%、80%、90%和100%。5600元接近于当地上一年度职工月平均工资的100%（即最高档次），因此选择5600元作为缴费基数意味着按照当地职工月平均工资的最高标准进行缴纳。
- 5000元档次：同样根据，5000元最有可能是80%档次，即第二档。这意味着个人选择的缴费基数是按照当地职工月平均工资的80%来计算。
缴费金额
- 5600元基数：选择5600元作为缴费基数时，个人需要承担的养老保险缴费比例为基数的8%，即448元（5600元 * 8%）。
- 5000元基数：选择5000元作为缴费基数时，个人需要承担的养老保险缴费比例为基数的8%，即400元（5000元 * 8%）。
养老金待遇
- 5600元基数：由于缴费基数越高，个人账户储存额就越多，退休时领取的养老金也相对较高。选择5600元作为缴费基数，退休后每月领取的养老金会相对较多。
- 5000元基数：选择较低的缴费基数，虽然每月缴费金额较低，但长期来看，个人账户储存额较少，退休后领取的养老金也会相应减少。
总的来说，社保基数越高，个人需要缴纳的金额越多，但退休后可领取的养老金也相对较高。在选择社保缴费基数时，应综合考虑个人经济状况、未来养老需求等因素。