吉林通化社保基数10000元时，扣税金额因工资构成及扣除项目不同而有所差异，一般在几百元左右。

• 社保缴纳情况：在吉林通化，社保通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。以社保基数10000元来计算，养老保险个人缴纳比例一般为8%，即800元；医疗保险个人缴纳比例约为2%，即200元。失业保险个人缴纳比例通常在0.5%左右，为50元。工伤保险和生育保险个人不缴费。所以，仅社保扣除部分大约为1050元。
• 个人所得税计算：在计算扣税金额前，需要先确定应纳税所得额。应纳税所得额 = 工资收入 - 社保扣除 - 专项附加扣除 - 起征点（5000元）。假设没有专项附加扣除，当社保基数为10000元时，应纳税所得额 = 10000 - 1050 - 5000 = 3950元。根据个人所得税税率表，3950元对应的税率为10%，速算扣除数为210元，则个人所得税 = 3950 × 10% - 210 = 185元。
• 其他可能扣除项：除了上述常规扣除外，还可能存在一些特殊情况的扣除，比如企业年金、职业年金等补充养老保险费，这些也会在一定程度上影响扣税金额。如果存在此类扣除项目，应纳税所得额会进一步减少，扣税金额也会相应降低。

吉林通化社保基数为10000元时，扣税金额需综合考虑社保缴纳和个人所得税等多方面因素，具体金额会因个人实际情况而有所不同。