合作医疗年限能否算入医保取决于具体医保类型和当地政策。 农村合作医疗（新农合）作为城乡居民医保的一部分，按年缴费且无累计年限要求，因此不能直接算作职工医保的缴费年限；但部分地区允许将城乡居民医保年限按比例折算为职工医保年限，需满足特定条件并补缴差额费用。
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合作医疗与医保的性质差异
农村合作医疗（现城乡居民医保）属于年度缴费制，保障当期医疗需求，不设累计缴费年限，与职工医保的长期缴费要求（男25-30年、女20-25年）存在本质区别。 -
职工医保的年限认定规则
职工医保要求累计缴费达到规定年限（含视同缴费年限）方可享受终身待遇，合作医疗缴费通常不计入，除非当地政策明确允许折算。例如，某些地区规定城乡居民医保每缴费1年可折算为职工医保3个月。 -
折算与补缴的实操路径
若退休时职工医保年限不足，可尝试将合作医疗年限折算补足，但需满足条件：缴费无重复、折算比例符合当地规定（如2018年后参保年限有效），并需一次性或按月补缴差额费用。 -
政策地域性与咨询必要性
各地医保政策差异较大，例如部分城市要求折算时实际缴费满10年，或仅限特定参保群体。建议直接咨询当地医保部门，获取个性化解决方案。
总结：合作医疗年限一般不能直接计入职工医保，但通过政策允许的折算和补缴可能实现年限衔接。及时了解地方细则并规划缴费方案，是确保医保待遇无缝衔接的关键。