山西长治市社保基数为16000元时，个人所得税的计算需结合社保缴纳情况和个人专项附加扣除。以下是具体说明：

一、基础计算（无专项附加扣除）

1. 应纳税所得额

   计算公式：
   $$应纳税所得额 = 工资收入 - 5000元（基本减除费用） - 社保及公积金 **
   若社保及公积金缴纳金额为0，则：
   $$应纳税所得额 = 16000元 - 5000元 = 11000元$$

2. 适用税率与速算扣除数
   根据2024年最新税率表，11000元属于 第二级税率 ，对应税率25%，速算扣除数1005元。

3. 应缴税款
   计算公式：
   $$应缴税款 = 应纳税所得额 \times 适用税率 - 速算扣除数$$
   $$应缴税款 = 11000元 \times 25% - 1005元 = 2750元 - 1005元 = 1745元$$
   但根据搜索结果2中的公式：
   $$应缴税款 = (16000元 - 3500元) \times 25% - 1005元 = 2120元$$
   可能存在地区性政策差异或计算标准不同。

二、考虑专项附加扣除的情况

若存在子女教育、赡养老人等专项附加扣除，可进一步减少应纳税所得额。例如：

• 子女教育专项附加扣除 ：每个子女每月1000元，两个子女可抵2000元；
• 赡养老人专项附加扣除 ：每月2000元。

示例 ：
若扣除2000元专项附加后，应纳税所得额为：
$$11000元 - 2000元 = 9000元$$
此时适用税率20%，速算扣除数1410元，应缴税款为：
$$9000元 \times 20% - 1410元 = 1800元 - 1410元 = 390元$$

三、总结

• 无专项附加扣除 ：16000元工资需缴纳1745元或2120元个税（地区政策差异）；
• 有专项附加扣除 ：可减少应纳税所得额，具体金额需根据扣除项目计算。建议结合自身实际情况，通过官方渠道确认当地最新税率及扣除标准。