关于“药房不让刷医保卡”的问题，其管理主体需根据具体情况判断，主要涉及以下部门：
一、医保刷卡的合规性监管主体
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医疗保障部门（医保局）
药店是否具备医保刷卡资格需经医保局审核批准，若未经批准擅自拒刷，可能涉及违规操作。医保局通过智能审核、实时监控等方式对定点药店进行定期稽查，确保合规性。
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卫生行政部门（卫健委）
卫生委负责医疗机构的监管，包括医保政策的执行情况。若涉及医疗机构与药店的协同问题，卫生行政部门可能介入调查。
二、投诉与维权途径
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医保局投诉
可拨打当地医保局热线（如12333）或书面举报，要求医保局核查药店是否具备医保定点资格及刷卡条件。
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卫生局投诉
若涉及医疗机构与药店的纠纷，可向当地卫生行政部门投诉，要求其介入调查。
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其他途径
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12345热线 ：拨打当地政务服务热线，咨询社保或市场监管部门；
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物价部门/药监部门 ：针对药品价格或质量问题，可向相关部门投诉；
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法律途径 ：若涉及盗刷等违法行为，可向公安机关报案。
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三、特殊情况说明
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电子凭证使用 ：医保局推广电子凭证（如手机APP、医保码）作为补充支付方式，若药店拒绝接受且无合理理由，可能影响医保报销。但电子凭证并非强制使用，药店不得以此为由拒刷医保卡。
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责任划分 ：若药店拒绝合规刷卡且无法提供合理解释，参保人员可要求药店承担相应费用或赔偿。
建议优先通过医保局或卫生行政部门投诉，若问题涉及多部门职责，可联合举报。保留好相关证据（如对话录音、刷卡记录等），以便后续维权。