医保余额和缴纳金额不一样，主要是因为医保缴费并非全部进入个人账户，而是分为统筹账户和个人账户两部分，其中个人缴纳部分通常全额划入个人账户，单位缴纳部分按比例划入（各地政策不同），剩余进入统筹基金用于全体参保人医疗共济。部分参保类型（如灵活就业）可能不设个人账户，缴费全部纳入统筹。
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账户分类机制：职工医保缴费由单位和个人共同承担，个人缴纳的2%一般全额计入个人账户，单位缴纳的6%-10%中仅部分划入个人账户（例如30%），其余进入统筹账户。居民医保通常不设个人账户，缴费全部纳入统筹。
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地区政策差异：不同省市划拨比例不同，例如北京45岁以下职工单位缴费的0.8%进入个人账户，上海则按年龄段划分比例。部分城市甚至取消单位缴费划入个人账户（如武汉）。
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参保类型影响：灵活就业人员按最低档缴费时，可能不建立个人账户；职工医保退休后个人账户划入金额也可能减少，改为定额拨款（如改革后多数地区按养老金2.5%划入）。
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资金用途限制：个人账户余额仅用于医疗消费，不能提现或转移；而统筹账户资金用于报销住院、门诊大病等费用，与个人账户完全隔离。
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年度调整与扣费：部分城市每年重置账户划拨规则，或从账户余额中扣除大病保险等费用，导致账面金额变化。
医保余额差异本质是“个人储蓄”与“公共基金”的分配结果，具体比例需咨询当地医保局。建议定期通过医保平台查询缴费明细，了解账户动态。