可以
南通医保卡在上海的使用情况如下：
一、异地就医直接结算
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已开通异地就医服务的城市
南通与上海已开通异地就医直接结算，南通参保人员持医保卡可在上海近350家定点医疗机构（含三甲医院和社区卫生服务中心）直接刷卡结算门诊和住院费用。
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备案要求
需提前办理异地就医备案手续，备案成功后即可使用直接结算功能。
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结算范围
覆盖门诊、住院费用，门诊费用需在收据开具之日起6个月内报销。
二、其他注意事项
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电子社保卡限制
目前南通电子社保卡尚未与上海实现联网，需通过线下渠道报销。
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未开通城市的处理方式
若目的地未开通异地结算，需先垫付费用后回南通报销。
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长居上海人员的特殊政策
长居上海的南通人需办理长居备案后，可在上海直接刷卡结算门诊费用；其他常住外省人员仍需垫付后报销。
三、报销流程（未直接结算城市）
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先垫付医疗费用；
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携带身份证、社保卡、医疗费用收据及病历资料至南通医保事务中心或街道医保服务点；
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提交材料审核通过后，按参保地政策报销。
总结
南通医保卡在上海的使用需根据就医城市是否开通异地结算功能判断，已开通的城市（如上海）支持直接刷卡结算，未开通的城市需先垫付后报销。建议出行前通过南通医保官方渠道确认最新政策。