根据河南省南阳市的社保政策，灵活就业人员确实可以选择只缴纳医疗保险，具体规定如下：

一、灵活就业人员参保选择权

1. 参保范围

   无雇工的个体工商户、未在用人单位参保的职工、非全日制从业人员等灵活就业人员，均可参加职工基本医疗保险，且允许单独缴纳医保。

2. 社保与商业险的差异

   医疗保险属于社会保险，而灵活就业人员通常选择的是商业医疗保险（如灵活就业医保）或城乡居民医保。两者性质不同，前者是强制性的社会福利，后者属于自愿参保的补充保障。

二、缴费方式与待遇

1. 缴费材料

   城镇户籍居民需携带身份证、户口本、失业证等材料申请；非城镇户籍居民需通过就业单位参保，农业户籍居民可申请新型农村医保。

2. 待遇差异

   • 职工医保 ：缴费满15年且达到退休年龄可终身享受待遇，但仅限参保人员本人使用。

   • 城乡居民医保 ：费用较低，报销比例也较低，但同样提供基础医疗保障，可终身享受。

三、注意事项

1. 养老保障风险

   若仅缴纳医保而不参保养老保险，退休后将无法享受养老金，可能面临生活风险。建议根据经济状况选择参保方式。

2. 地区政策差异

   不同城市对灵活就业人员的社保政策可能存在细微差异，建议咨询当地社保部门确认具体操作流程和待遇标准。

2025年河南南阳的灵活就业人员可以选择单独缴纳医疗保险，但需根据自身经济状况权衡养老保障需求，并了解城乡居民医保与职工医保的待遇差异。