根据我国现行社保政策，员工在公司缴纳职工医保后，无需再缴纳农村医疗保险（新农合）。以下是具体说明：
一、政策依据与账户唯一性
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社保账户唯一性
我国实行社保账户“一人一户”制度，即每个人只能拥有一个社保账户，无法同时参加职工医保和新农合。
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法律依据
《社会保险法》第二十三条明确规定：“职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。” 这意味着职工医保是法定的强制参保项目，而新农合属于自愿参保的补充性医疗保障，两者不可同时享受。
二、两种医保的差异与冲突
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保障范围与待遇
职工医保由政府主导，覆盖城镇职工，保障水平较高；新农合主要覆盖农村居民，缴费标准较低，待遇相对基础。
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重复参保处理
若已参加职工医保后再次参保新农合，系统会自动终止职工医保，且无法恢复。若发现重复参保，可要求退回多缴费用。
三、特殊情况说明
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户籍与就业地差异 ：若户籍在农村但已到城市工作并参加职工医保，通常无需再缴新农合，但需注意转移职工医保关系。
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新农合升级为城乡居民医保 ：部分地区将新农合整合为城乡居民医保，这种情况下也不需再单独缴纳新农合费用。
四、建议与注意事项
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咨询确认 ：若对单位参保情况有疑问，建议向当地社保部门核实。
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权益保障 ：职工医保的缴费年限和报销比例通常高于新农合，建议优先选择职工医保以获得更全面的保障。
员工在公司缴纳职工医保后，无需再缴纳农村医疗保险，且两者不可同时享受。若存在政策差异或特殊情况，建议通过正规渠道咨询确认。