公司缴纳职工医保的最低缴费基数根据地区政策规定执行，主要分为以下情形：
一、缴费基数确定标准
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职工个人缴费基数
- 以职工本人上年度月平均工资为基数，若低于当地职工月平均工资60%的，按60%计算；若高于300%的，超过部分不计入缴费基数。
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单位整体缴费基数
- 以单位全部职工缴费工资基数之和为基数，最低不低于当地职工月平均工资的60%，最高不超过300%。
二、特殊群体与政策说明
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灵活就业人员
- 以当地上年度全口径月平均工资的80%为基数，缴费费率为9.5%（含大病医疗互助补充保险）。
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困难企业
- 经认定后，单位可以上年度全省全口径平均工资的60%为基数，按5%的比例缴纳。
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机关事业单位
- 以单位上年度职工工资总额为基数，单位缴费7.3%，个人缴费2%。
三、缴费基数调整机制
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缴费基数每年根据当地经济水平和职工收入变化调整，例如2024年上海最低缴费基数为6056元。
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新入职员工以起薪当月工资为基数计算，转正后按实际工资调整。
四、地区差异示例
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上海市 ：2025年最低缴费基数为6056元，灵活就业人员基数为6056×80%。
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苏州市 ：2025年最低缴费基数为6056元，企业缴费比例最低3%。
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保定市 ：2024年最低缴费基数为6056元，灵活就业人员缴费基数为6056×80%。
五、注意事项
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若职工工资低于当地平均工资60%，单位可能通过其他方式（如财政补贴）保障职工医保权益。
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具体缴费金额由单位代扣代缴，职工无需直接支付。
以上信息综合了全国不同地区的政策规定，实际执行中需以当地最新政策为准。