新生儿农村合作医疗报销流程及注意事项如下：

一、参保时间与待遇

1. 参保时间限制

   新生儿需在出生后 3个月内 完成参保登记并缴费，才能享受医保报销待遇。若超过3个月参保，需从次月开始计算医保待遇。

2. 出生前医疗费用报销

   若新生儿在参保前已办理医保登记，出院时可直接使用医保卡结算；若未参保，需提供医疗费用发票等材料补办参保手续后报销。

二、报销流程

1. 办理参保登记

   • 携带户口本、出生证原件及复印件至户籍所在地乡镇（街道）的城乡居民医保经办机构办理参保登记。

   • 完成缴费后，户籍登记满15个工作日可办理市民卡。

2. 住院报销流程

   • 在定点医疗机构办理住院手续时，需出示新型农村合作医疗证。

   • 出院时直接结算医保报销部分，剩余费用由个人承担。

3. 门诊报销流程

   • 部分地区设置门诊起付线（如50元），在定点医疗机构就诊时直接刷卡报销。

   • 未直接结算的门诊费用可携带户口本、家长身份证、门诊发票等材料至医保经办机构办理。

三、所需材料

• 住院报销 ：诊断证明书、住院通知单、费用明细清单、出院小结等。

• 门诊报销 ：门诊发票、合作医疗证历本（或病历）等。

• 参保登记 ：户口本、出生证、缴费通知单、市民卡（部分地区需）。

四、其他注意事项

1. 异地就医

   若在异地就医，需提前办理转诊备案手续，报销流程与本地就医一致。

2. 特殊群体

   农村低保、五保供养等特殊群体，若医疗费用超出医保报销范围，可申请医疗救助。

3. 报销比例与起付线

   具体报销比例因地区而异，通常门诊和住院都有起付线限制，建议咨询当地医保部门。

五、法律依据

报销依据为《中华人民共和国社会保险法》第二十四条和第二十六条，管理办法由国务院规定。

通过以上流程和注意事项，可确保新生儿顺利享受农村合作医疗报销政策。若需进一步确认，建议咨询当地医保经办机构。