医院的管理涉及多个层级的卫生行政部门，具体管理主体如下：
一、最高层级管理部门
国务院卫生行政部门
负责全国医疗机构的监督管理工作，制定医疗卫生政策、药品管理及医药卫生体制改革等宏观管理职能。
二、地方层级管理部门
县级以上地方人民政府卫生行政部门
承担本行政区域内医疗机构的日常监督管理职责，包括：
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医疗服务质量监管
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医疗纠纷处理
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疾病预防控制（如传染病监测）
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妇幼卫生服务
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卫生监督执法（如《医疗机构管理条例》执行）
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突发公共卫生事件应对等
三、卫生行政部门的内部机构
卫生行政部门通常下设以下职能科室：
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办公室 ：综合协调部门
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医政科 ：医疗质量与安全监管
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健教所 ：健康教育与促进
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爱卫会 ：爱国卫生运动组织
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疾病预防控制中心 ：慢性病、传染病防控
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妇幼保健院 ：妇幼卫生服务管理
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卫生监督所 ：具体行政执法
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爱卫会 ：卫生环境监督
四、其他相关机构
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中国人民解放军卫生主管部门 ：军队医疗机构监督管理
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国家卫生部 （现为国家卫生健康委员会）：原负责医药卫生体制改革和药品管理，现职能转移至卫健委
总结
医院的管理以卫生行政部门为核心，实行分级负责制。地方卫生局（所）是具体执行单位，而国务院卫生行政部门则负责全国性政策制定与宏观监管。