存在差异
职工医保和合作医疗的住院报销比例存在一定的差异，具体如下：
- 职工医保住院报销比例 ：
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一级医院 ：在职职工报销比例为90%，退休职工报销比例为93%。
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二级医院 ：在职职工报销比例为85%，退休职工报销比例为89.5%。
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三级医院 ：在职职工报销比例为80%，退休职工报销比例为86%。
- 合作医疗住院报销比例 ：
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镇卫生院 ：报销比例为60%。
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二级医院 ：报销比例为40%。
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三级医院 ：报销比例为30%。
- 大病报销比例 ：
- 参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。
- 其他特殊政策 ：
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60周岁以上老人在卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
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学生、儿童在一个结算年度内，发生符合报销范围的18万元以下医疗费用，三级医院起付标准为650元，报销比例为50%，上限为2000元；二级医院起付标准为300元，报销比例为60%；一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
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年满70周岁及以上在一个结算年度内，发生符合报销范围的10万元以下医疗费，三级医院起付标准为650元，报销比例为50%，上限为2000元；二级医院起付标准为300元，报销比例为60%；一级医院不设起付标准，报销比例为65%。
这些数据表明，职工医保的报销比例普遍高于合作医疗，且在不同医院级别和不同情况下（如在职、退休、特殊人群等）的报销比例也有所不同。建议根据具体情况和所在地区的政策，选择合适的医保类型以获得更高的报销比例。