小儿尖头并指趾综合征治疗强调个体化、多学科诊疗模式，不存在绝对最快的方法，通常需综合多方面措施来提升治疗效果。
- 多学科评估及随访：小儿科医生协调下，联合整形外科、神经外科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、心理科、康复科等，对患儿高颅压、呼吸、视力和听力等问题进行评估及长期随访，以便及时发现问题并调整治疗方案。
- 药物治疗：针对出现颅内高压的患儿，可使用甘露醇、甘油果糖等降颅压药物对症处理，缓解因颅内压过高带来的头痛等不适，防止对神经系统造成进一步损伤 。
- 手术治疗：
- 颅眶骨畸形手术：出生后 4 - 6 个月时，行前部眶骨前移术；出生后 6 个月 - 1 岁再行后颅延长术，以改善颅眶部畸形，避免影响脑发育和视力等。
- 并指（趾）畸形手术：医生会综合评估患儿并指（趾）畸形严重程度、一般状况等制定方案。一般建议在 6 个月 - 3 岁前早期行指（趾）分叉术，促进手部功能发育，减少对心理的影响。
- 颌面骨畸形手术：患儿 6 - 7 岁时，常进行整体骨前移术或 Le FortⅢ 截骨术来矫正颌面骨畸形。近年来骨延长器技术也用于面中部发育不全的治疗。8 岁至青春期，在颅颌面团队评估下，积极开展口腔正畸、正颌治疗。青春期后，根据医疗团队评估及自身外观需要，可进一步采取美容整形手术 。
- 康复治疗：对于存在智力障碍的患儿，在康复医师指导下开展个体化康复训练，包括运动康复、感觉康复、语言康复等，帮助提升患儿生活能力和认知水平 。
小儿尖头并指趾综合征治疗复杂，需长期坚持多学科综合治疗，家长应积极配合医生，按计划带患儿治疗和复诊，以促进患儿尽可能良好地恢复。