小儿肺隔离症的病因主要包括以下几方面：

• 先天性发育异常：在胚胎发育时期，肺组织的发育出现异常，导致一部分肺组织与正常的肺分离，形成了肺隔离症。可能是肺部原始组织的血管分布、支气管分支等出现异常，使得部分肺组织无法与正常肺组织建立联系，这部分隔离的肺组织通常与正常支气管树没有连接。
• 血管异常：异常的体循环动脉供血是导致小儿肺隔离症的一个重要因素。隔离的肺组织通常由来自体循环的异常血管供血，而没有正常的肺静脉引流，导致血液在隔离的肺组织内循环不畅，引起局部血液循环障碍。
• 遗传因素：部分研究表明，遗传因素可能在肺隔离症的发生中起到一定作用，可能与某些基因突变或染色体异常有关，但具体的遗传机制尚未明确。
• 其他因素：胎儿宫内感染如风疹、巨细胞病毒、弓形虫等，可能侵犯胎儿肺部组织，导致炎症反应，影响肺部正常发育形成隔离肺。母体的某些疾病和状况，如孕期营养不良、压力过大、吸烟、药物暴露、接触有害化学物质等环境因素也可能对胎儿肺发育产生不利影响，增加胎儿患隔离肺的风险。在一些罕见的情况下，外部创伤如产伤或其他类型的损伤，可能导致肺部组织损伤和隔离。