根据2025年上海农村合作医疗（新农合）政策，自费金额超过5000元后即可启动报销机制，具体报销规则如下：
一、门诊报销
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村卫生室/镇卫生院
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药费超过10元部分按60%报销，针灸、理疗等辅助治疗限额50元/次；
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年度累计最高报销5000元，超出部分自费。
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县级医院
- 检查费超过50元部分报销30%，中药处方单贴可额外补贴1元。
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市级及省级医院
- CT、核磁共振等大型检查单次限报200元，超过部分按比例报销（如55%、50%）。
二、住院报销（分段补偿）
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起付线标准
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2025年统一起付线为5000元，超过部分分段补偿：
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5001-10000元：65%
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10001-18000元：70%
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18001元以上：80%。
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特殊病种与附加待遇
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尿毒症、肿瘤放化疗等12种重大疾病，年累计自费超过5000元，可获1.1万元补偿；
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60岁以上老人、儿童、学生等特殊群体，在三级医院报销比例提高至50%-65%。
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三、注意事项
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报销比例差异 ：不同医疗机构级别报销比例不同，建议优先选择基层医疗机构以降低自费；
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年度封顶线 ：门诊和住院均设年度封顶线（如5000元），超出部分需自费；
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及时就医 ：部分检查项目（如CT）需单独申请，超时可能影响报销比例。
以上政策综合了2022-2025年最新调整，具体执行以医保部门官方说明为准。