社保卡已激活后不能在药店使用的原因可能有以下几种：
- 未开通社保卡支付 ：
- 社保卡激活后需要在24小时内去指定药店或医疗机构刷卡才可以开通医保支付。如果没有满足这个条件，则不能去药店刷卡消费。
- 社保暂停缴费或未交医保 ：
- 如果社保中途暂停了也会导致无法使用。可以关注微信“智慧人社”查询一下缴保状态。如果没交医保，则一定不能使用。
- 没有设置交易密码 ：
- 社保卡有查询密码、金融密码和交易密码。如果交易密码没有激活，则无法在药店买药。需要激活交易密码。
- 医保费用未到账 ：
- 药店买药只能用自己医保个人账户内的余额。如果医保个人账户内余额已经用光，或者刚刚领取到社保卡，医保费用还没有到账，则无法在药店刷社保卡买药。
- 居民医保没有个人账户 ：
- 如果缴纳的是城乡居民医疗保险，是没有个人账户的，这种社保卡即使激活后也没有办法在医保定点药店买药。
- 未激活医保账户 ：
- 新社保卡有两个账户，一个是金融账户，另一个是医保账户。如果只激活了金融账户，而忘记激活医保账户，则医保账号里的钱不能使用。
- 跨区域使用 ：
- 如果跨区域使用社保卡，可能因为社保信息共享未完成而无法使用。
- 选择低档次标准缴费 ：
- 对于灵活就业人员，如果选择的是最低档次的标准缴纳医保，则没有医保个人账户，也就没有医保返款，无法在药店买药。
根据以上原因，建议逐一排查并解决问题，以确保社保卡能在药店正常使用。