淮南和淮北的“橘子”存在以下区别，主要源于地理环境差异导致的物种分化：
一、植物学分类差异
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物种不同
淮南和淮北的“橘”实为不同物种。淮南产的是柑橘属植物（真橘），而淮北产的是芸香科柑橘属的枳属植物（枳或枸橘），两者在遗传基因和形态特征上有本质区别。
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果实特征对比
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淮南真橘：果实甜润多汁，富含维生素C。
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淮北枳：果实酸涩，种子多且带有苦味，果肉较少。
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二、地理环境因素
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气候差异
淮南属亚热带季风气候，年均气温较高（冬季约3.5℃），降雨量较少且季节分布不均；淮北属温带季风气候，冬季寒冷（可降至-21.3℃），四季分明且降水适中。
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土壤与光照
淮南土壤肥沃，光照充足，适合柑橘类植物生长；淮北土壤偏碱性，光照时长较短，对柑橘生长有一定限制。
三、文化与历史背景
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名称差异
由于地理隔离，淮南和淮北分别形成了“橘”和“桔”的称呼，南方多用“橘”，北方多用“桔”，实为同一物种的不同地域变种。
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成语寓意
“橘生淮南则为橘，生于淮北则为枳”这一成语源于古代观察，现多比喻环境对事物性质的影响，而非指两种不同物种。
总结
淮南和淮北的“橘子”本质上是同种柑橘属植物因地理环境差异形成的不同品种，淮南产真橘（甜），淮北产枳（酸），类似水稻南种北变种的现象。这一现象也体现了秦岭淮河作为我国南北气候分界线的地理意义。