新生儿出生当天住院是否可以报销医保，需根据参保时间、地区政策及费用类型综合判断，具体说明如下：

一、参保时间与待遇享受期

1. 出生后90天内参保

   当年出生的新生儿（含死亡新生儿）需在出生后90天内办理参保登记并缴费，自出生之日起即可享受医保待遇。

2. 错过参保时间的影响

   若超过90天参保，仅能报销参保缴费后的医疗费用，出生前产生的费用需自费。

二、报销范围与比例

1. 报销范围

   • 出生时住院费用 ：部分地区规定仅报销母婴同室费用，不包含母亲个人住院费用；

   • 普通门诊 ：300元内可报销40%（每年最高120元）；

   • 大病门诊 ：按比例支付，无起付金额；

   • 住院费用 ：根据医院等级设定起付标准（如三级医院500元起付，报销80%）。

2. 报销比例差异

   具体比例因地区政策不同而有所差异，建议咨询当地医保部门。例如：

   • 某地规定出生时住院费用报销100%；

   • 另一地区仅报销60%。

三、注意事项

1. 父母医保不可直接用于新生儿

   新生儿医保与父母医保是独立账户，需以新生儿名义参保缴费；

   原来的“少儿互助金”已并入城乡居民基本医疗保险，学生儿童统一参保“学生儿童档”。

2. 特殊情况处理

   • 出生后死亡但90天内参保的新生儿，其医疗费用可按政策报销；

   • 未参保导致的自费部分需自行承担。

四、办理建议

1. 及时参保 ：出生后尽早（建议24小时内）办理参保登记，避免影响报销；

2. 材料准备 ：报销时需提供新生儿身份证明、父母身份证、住院发票等材料；

3. 地区政策差异 ：不同城市对出生时住院费用的报销政策存在差异，建议提前咨询当地医保部门。

综上，新生儿出生当天住院能否报销医保，关键在于是否在90天内完成参保登记。若符合条件，出生时产生的合规医疗费用可按规定报销，但需注意报销范围及比例的地域差异。