长期进行零申报的小规模企业可能会面临以下几方面的风险和影响：

1. 1.被纳入重点监控：税务机关可能会将长期零申报的企业纳入重点监控范围，进行纳税评估。如果在评估过程中发现企业存在隐瞒收入、虚开发票等行为，企业将被要求补缴当期税款与滞纳金，并可能被处以罚款，情节严重的还可能被移送稽查
2. 2.信用等级下降：长期零申报可能导致企业的纳税信用等级下降。例如，一个评价年度内增值税连续3个月或累计6个月零申报、负申报的企业，不能评为A级
3. 3.发票管理受限：对于长期零申报且持有发票的纳税人，税务机关可能会对其发票进行降版降量，并要求纳税人定期前往税务机关对发票的使用进行核查
4. 4.收入核定：税务机关可能会通过核查，采用成本费用公式核定企业的收入
5. 5.营业执照被吊销的风险：如果公司成立后无正当理由超过6个月未开业，或者开业后自行停业连续6个月以上，税务机关可能会吊销企业的营业执照
6. 6.财务数据不完整：长期零申报可能导致企业的财务数据不够完整，影响企业的信用记录和融资能力
7. 7.税务风险增加：长期零申报可能引发税务部门的关注和审查，增加企业的管理成本和风险
8. 8.罚款和滞纳金：如果企业未按照规定进行纳税申报，可能会面临罚款和滞纳金的处罚
9. 9.税务注销：如果小规模纳税人在连续一定期间内（如180天）未发生经营业务且未进行纳税申报，税务机关可能会注销该企业的税务登记

长期零申报对小规模企业来说存在诸多风险和不利影响。建议企业在没有实际经营业务的情况下，也要按照相关规定进行零申报，并积极与税务机关沟通，确保合规运营。如果企业有特殊情况或疑问，建议咨询专业税务顾问或律师，以避免不必要的麻烦。