根据搜索结果，2025年四川巴中治疗夜间咳嗽的医院主要有以下推荐：
一、综合性医院
- 巴中市中心医院
- 巴中市唯一的三级甲等综合医院，设有呼吸内科专业，配备先进设备如电子支气管镜、肺功能仪等，可处理哮喘、慢性支气管炎等引起的夜间咳嗽。
- 地址：巴中市南池河街1号。
- 巴中市中医院
- 国家三级甲等中医医院，肺病科擅长呼吸系统疾病（如哮喘、肺炎）的诊治，提供中西医结合治疗，包括中药雾化、穴位贴敷等特色疗法。
- 地址：巴州区郑家街院区或回风院区。
二、专科医院
- 巴中康达医院
- 二级综合医院，呼吸内科专业可处理呼吸道感染、慢性咳嗽等疾病。
- 地址：巴中市巴州区杨家坝中杨干道158号。
三、其他推荐
- 通江县人民医院：2025年正在申报三级甲等综合医院评审，若通过可能成为区域内更优质的诊疗选择。
- 成都中医哮喘病医院：虽位于成都，但搜索结果中多次被提及为川内呼吸疾病专科医院，适合重症或需转诊患者。
注意事项
- 夜间咳嗽的病因：可能是哮喘、过敏、胃食管反流等，建议优先选择配备呼吸专科或肺功能检测设备的医院（如巴中市中心医院）。
- 就诊准备：可提前通过医院官网或电话查询科室排班，部分医院支持线上预约。
如需更完整信息，可参考搜索结果中的医院官网或拨打当地卫生热线咨询。