根据搜索材料和综合分析，以下是中国治疗甲状腺疾病较好的三甲医院排名：
内分泌科排行榜
- 1.上海交通大学医学院附属瑞金医院
- 2.北京协和医院
- 3.中国人民解放军总医院
- 4.中南大学湘雅二医院
- 5.上海市第六人民医院
- 6.四川大学华西医院
- 7.中国医科大学附属第一医院
- 8.中山大学附属第一医院
- 9.北京大学第一医院
- 10.中山大学孙逸仙纪念医院
核医学科排行榜
1.北京协和医院
2.华中科技大学同济医学院附属协和医院
3.四川大学华西医院
4.中国人民解放军总医院
5.中国医科大学附属第一医院
6.第四军医大学西京医院
7.复旦大学附属中山医院
8.复旦大学附属华山医院
9.上海交通大学医学院附属瑞金医院
10.上海交通大学医学院附属仁济医院
普外科排行榜
1.北京协和医院
2.复旦大学附属中山医院
3.四川大学华西医院
4.中国人民解放军总医院
5.上海交通大学医学院附属瑞金医院
6.中山大学附属第一医院
7.华中科技大学同济医学院附属同济医院
8.北京大学人民医院
9.浙江大学医学院附属第一医院
10.南京军区南京总医院
肿瘤科排行榜
1.中国医学科学院肿瘤医院
2.复旦大学附属肿瘤医院
3.中山大学肿瘤防治中心
4.天津医科大学肿瘤医院
5.北京大学肿瘤医院
6.山东省肿瘤医院
7.浙江省肿瘤医院
8.四川大学华西医院
9.江苏省肿瘤医院
10.哈尔滨医科大学附属肿瘤医院
综合推荐
1.北京协和医院：在核医学科和普外科方面表现突出，综合实力强
2.四川大学华西医院：在甲状腺外科和肿瘤科方面排名靠前，尤其在晚期甲状腺癌的手术治疗方面处于国际、国内领先水平
3.上海交通大学医学院附属瑞金医院：在内分泌科、核医学科和普外科方面均有出色表现
4.华中科技大学同济医学院附属同济医院：在甲状腺乳腺外科方面表现突出，设有甲状腺乳腺外科专家门诊和知名专家门诊
5.中国人民解放军总医院：在普外科和核医学科方面表现优异
这些医院在甲状腺疾病的诊断和治疗方面都有丰富的经验和先进的技术，可以根据具体病情和地理位置选择合适的医院就诊。