根据搜索结果，北京治疗吞咽障碍最权威的医院主要集中在综合实力强、专科特色突出的三甲医院。结合不同病因和治疗方向，推荐以下医院：

1. 北京协和医院

• 推荐理由：作为全国综合排名第一的医院，其神经内科和康复医学中心在吞咽障碍诊疗方面经验丰富，尤其擅长神经系统疾病（如脑卒中、帕金森等）引起的吞咽障碍。
• 特色：多学科协作，可结合消化内镜技术评估食管功能。

2. 北京天坛医院

• 推荐理由：神经内科和神经外科全国领先，擅长脑血管病、脑外伤等神经系统疾病引发的吞咽障碍。
• 特色：提供精准的神经功能评估和康复治疗方案。

3. 北京积水潭医院

• 推荐理由：康复医学中心在吞咽障碍的康复训练（如口腔运动训练、吞咽反射训练）方面技术成熟。
• 适用人群：术后或创伤后吞咽功能恢复需求者。

4. 首都医科大学附属北京安贞医院

• 推荐理由：消化内科专家擅长通过内镜技术诊断和治疗食管、胃肠疾病相关的吞咽问题。
• 适用情况：消化道肿瘤、胃食管反流等器质性病变导致的吞咽障碍。

5. 北京儿童医院

• 推荐理由：针对儿童吞咽障碍（如脑瘫、发育迟缓等）有专门评估和干预团队。
• 特色：结合语言发育评估和神经康复治疗。

6. 首都医科大学附属北京安定医院

• 推荐理由：精神科全国排名前列，擅长精神心理因素（如神经性厌食）引起的进食障碍。
• 适用情况：心因性吞咽困难或合并焦虑、抑郁症状者。

选择建议：

• 神经系统疾病相关：优先选择北京协和医院、北京天坛医院。
• 康复治疗需求：北京积水潭医院或安定医院康复科。
• 儿童患者：北京儿童医院。
• 消化系统病因：北京安贞医院。

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