根据搜索材料和相关政策法规，三甲医院和二医院的报销比例确实存在一定的差异。以下是具体的区别：
- 1.住院报销比例：三甲医院：住院报销比例通常较低。例如，北京在职职工在三甲医院的住院报销比例为85%二甲医院：住院报销比例通常高于三甲医院。例如，北京在职职工在二级医院的住院报销比例为87%
- 2.门诊报销比例：三甲医院：门诊报销比例也较低。例如，北京在职职工在三甲医院的门诊报销比例为70%二甲医院：门诊报销比例通常高于三甲医院。例如，北京在职职工在二级医院的门诊报销比例为70%
- 3.起付线：三甲医院：起付线通常较高。例如，北京在职职工在三甲医院的起付线为800元二甲医院：起付线通常低于三甲医院。例如，北京在职职工在二级医院的起付线为500元
- 4.报销限额：三甲医院：年度住院费用最高报销限额较高。例如，二档年度住院费用最高报销限额为30万元二甲医院：年度住院费用最高报销限额也较高，但可能略低于三甲医院。例如，二档年度住院费用最高报销限额为30万元
- 5.其他因素：参保人身份：退休职工医保参保人的报销比例通常高于在职职工医保参保人，而居民医保参保人的报销比例最低。地区差异：不同地区的报销政策可能有所不同，具体报销比例和限额需要参考当地医保政策
三甲医院和二医院的报销比例确实存在一定的差异，通常三甲医院的报销比例较低，起付线较高，而二甲医院的报销比例较高，起付线较低。具体报销比例和限额需要根据当地医保政策和参保人身份来确定。