融合基因检测是一种分子生物学技术，旨在识别两个或多个基因序列由于染色体结构重排而连接在一起形成的新基因序列。这种基因变异在多种疾病中扮演重要角色，尤其是在癌症中，如白血病、肺癌、乳腺癌等。
融合基因的定义
融合基因是指原本独立存在的两个或多个基因的部分或全部序列通过某种机制相互融合，形成了一个新的基因。这通常发生在DNA水平上，是由于染色体重排导致的，比如染色体易位、插入、缺失、倒位或者染色体碎裂等过程。在转录组层面也可能发生融合，即两个不同基因转录产生的RNA在特定情况下融合在一起，形成新的融合RNA。
融合基因的产生机制
融合基因的产生主要是由于染色体层面的重排，包括：
- 染色体易位：这是最常见的类型之一，指的是一个染色体上的片段与另一个染色体上的片段交换位置，从而导致了两个不相连的基因部分被拼接在一起。
- 插入：一段DNA序列被插入到另一段DNA序列中，可能会引起基因间的融合。
- 缺失：某些DNA片段的丢失可能导致相邻基因的直接连接。
- 倒位：一段DNA序列在同一条染色体内反向插入，可能造成基因内部或之间的重新排列。
- 染色体碎裂：这是一种较为复杂的重排方式，涉及多处断裂和重组，可以导致多个基因片段的混乱组合。
融合基因检测的意义
融合基因检测对于疾病的诊断、分类、预后评估以及靶向治疗的选择具有重要意义。例如，在慢性粒细胞性白血病（CML）中，BCR-ABL融合基因的存在是诊断该疾病的关键标准之一，并且针对这一特定融合基因产物的药物伊马替尼（Imatinib）已经被证明对多数患者有效。
融合基因还能够作为微小残留病（MRD）监测的生物标志物。通过对融合基因表达水平的监测，可以帮助预测白血病的复发风险，指导临床治疗决策。
检测方法
目前，常用的融合基因检测方法主要包括荧光原位杂交（FISH）、逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）、免疫组织化学（IHC）以及二代测序技术（NGS）。其中，NGS技术因其高通量和高灵敏度的特点，逐渐成为研究和临床应用中的主流选择。基于RNA的NGS相较于基于DNA的NGS在检测融合基因方面显示出更高的准确性和敏感性，因为它更接近于实际表达情况。
实际应用案例
以非小细胞肺癌为例，近年来针对融合基因的靶向治疗取得了显著进展。例如，ALK、ROS1、RET等基因的融合突变已被确认为有效的治疗靶点，相应的靶向药物也获得了批准上市。这些发现不仅提高了患者的生存率，也为个性化医疗提供了强有力的支持。
融合基因检测是一项重要的工具，它帮助医生更好地理解疾病的本质，为患者提供更加精准的治疗方案。随着技术的进步，未来这项技术的应用范围还将进一步扩大，有望惠及更多类型的疾病患者。