海南岛由于其独特的地理位置和丰富的水域资源，拥有种类繁多的本土鱼类。这些鱼类不仅对维持当地的生态平衡至关重要，同时也是当地文化和经济的重要组成部分。以下是对海南本土鱼种的详细介绍：
海洋鱼类
在海洋鱼类方面，海南岛因其位于热带地区而享有丰富多样的海鱼资源。市场上的常见海鱼包括马头鱼、黄花鱼、黄姑鱼、白姑鱼等。还有一些具有代表性的物种如马鲛鱼，这种鱼肉质鲜美，营养丰富，在民间素有“山上鹧鸪獐，海里马鲛鱼”的美誉。还有石斑鱼，它是一种高档的海水鱼类，其种类繁多，如红斑、青斑、东星斑等，肉质鲜嫩，富含蛋白质、维生素和矿物质等营养成分。
溪流与淡水鱼类
海南的溪流中生活着众多本地特有的鱼类。例如，海南鳜鱼被誉为“淡水鱼中之王”，体态优美，肉质细腻；海南溪石斑鱼体色鲜艳，肉质鲜美，兼具观赏和食用价值。根据各种鱼类主要生活环境和生活水层的不同，海南岛的淡水鱼类可以分为急流上层类群（如海南异鱲、马口鱼）、缓流水体类群（如歧尾斗鱼、斑鳢）以及流水急流水中下层类群（如鮈亚科、鲴亚科）。
特产鱼类
海南特产鱼类还包括万泉河中的凤尾鲤，这种鱼身及尾鳍较长，呈桔红色，鳞色鲜艳，生活在万泉河中下游的深湾和急水滩处。尖鳍鲤，俗称“海鲤”，是海南省的重点保护对象之一，近年来通过人工繁育技术的成功突破，尖鳍鲤的数量得到了一定的恢复。
保护措施
为了保护这些珍贵的鱼类资源，海南省政府采取了一系列措施。例如，实施内陆禁渔期制度，以减少捕捞压力，促进鱼类种群的自然恢复。天角潭水利枢纽工程特别设计了2.3公里长的鱼道，确保洄游鱼类能够顺利从下游到达上游繁殖区域。同时，松涛水库作为海南重要的淡水鱼类种质资源库，分布着海南61%的淡水鱼类种类，并且是国家Ⅱ级保护动物大鳞鲢、琼中拟平鳅和海南鳌等珍稀濒危鱼类的重要栖息地。
外来入侵物种的影响
值得注意的是，外来入侵物种对海南土著鱼类造成了较大的影响。比如外来肉食性鱼类如鲯鱼、鲯鳅等已经在海南海域形成优势种群，威胁到了当地生态环境和渔业资源。因此，加强对外来物种的监控和管理，对于保护海南本土鱼类资源显得尤为重要。
海南本土鱼类资源丰富多样，但同时也面临着诸多挑战。通过科学合理的保护措施，不仅可以维护生物多样性，还能促进当地渔业的可持续发展。未来，随着更多科学研究成果的应用，相信海南的鱼类资源将得到更好的保护和发展。