灵活就业人员的社保缴费年限是否计入社保总年限，需根据具体情况判断，主要分为以下几种情况：
一、灵活就业人员社保缴费年限的认定
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基本养老保险
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缴费年限累计计算 ：灵活就业人员以个人身份参保的基本养老保险，其缴费年限与单位职工的缴费年限累计计算。
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视同缴费年限 ：若灵活就业人员属于1995年前参加工作但未参加社保的下岗职工，且其工作年限符合当地规定（如国有企业改制前工作年限），则可认定为视同缴费年限。
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医疗保险
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累计缴费要求 ：男性累计缴费满25-30年，女性满20-25年，达到退休年龄后可享受终身医保待遇。
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无“工龄”概念 ：医疗保险的缴费年限与工龄无关，仅以实际缴费年限为准。
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二、特殊情形说明
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完全灵活就业人员 ：1992年养老保险制度改革后参保的个体户或自由职业者，无视同缴费年限，所有缴费年限均按实际缴费计算。
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下岗职工转灵活就业 ：若原单位未参保，其1995年前的连续工龄不计入缴费年限；若原单位已参保但个人未缴费，视同缴费年限不累计。
三、养老金领取条件
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基本养老金 ：累计缴费满15年且达到法定退休年龄（男性60岁、女性50岁/55岁）。
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医疗保险待遇 ：需满足累计缴费年限要求，退休后终身享受医保待遇。
四、注意事项
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档案证据 ：认定视同缴费年限需提供个人档案，明确记载参加工作年限及缴费记录。
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地区差异 ：医疗保险的累计缴费年限具体年限可能因地区政策不同存在差异，建议咨询当地社保部门。
综上，灵活就业人员的社保缴费年限是否计入总年限，需结合参保时间、工作性质及当地政策综合判断。