根据濮阳市2025年医保政策的相关规定，如果用户在2025年只缴纳了三个月的医保费用，在住院报销方面会面临以下情况：

1. 等待期政策

根据濮阳市医保政策，未在2024年12月31日前完成参保缴费的人员，自2025年1月1日起将面临三个月的固定等待期。这意味着，即使您在2025年缴纳了医保费用，也需要等待三个月后才能享受住院费用的报销待遇。

2. 断缴影响

如果您在2024年年底未缴纳医保费用，那么2025年即使补缴，也会因为断缴而产生三个月的等待期。如果断缴超过一年，每多断缴一年，等待期将增加一个月。

3. 报销条件

住院费用报销需满足以下基本条件：

• 申请人已办理参保手续并足额缴纳医保费用；
• 就医于医保定点医疗机构；
• 住院费用符合医保报销范围，并已先行支付现金，同时保存相关单据。

4. 报销比例

住院费用的报销比例与医院级别有关，例如：

• 在三级医院住院：
  • 起付标准至3万元部分：报销85%，个人支付15%；
  • 3万元至4万元部分：报销90%，个人支付10%；
  • 超过4万元部分：报销95%，个人支付5%。

5. 结论

如果用户在2025年只缴纳了三个月的医保费用，由于等待期政策，住院费用将无法报销。建议用户在每年集中缴费期内及时缴纳医保费用，以免因断缴或未缴而影响待遇享受。

如需进一步了解具体政策，可以参考濮阳市医疗保障局的相关公告。