肛瘘是指肛门直肠与肛周皮肤异常管道，由内口、瘘管、外口三部分组成，分为单纯性肛瘘、复杂性肛瘘、低位肛瘘、高位肛瘘。
痔疮是指肛门直肠及直肠黏膜静脉丛淤血扩张屈曲而形成的一个或多个柔软静脉团，还有一种说法，肛门肛垫下移从而导致痔疮。痔疮一般分为内痔、外痔和混合痔。
两者的病因不同，肛瘘大部分由直肠肛管周围脓肿引起，还有些因为结核及溃疡性结肠炎、克罗恩病引起。痔疮是因为习惯性便秘、腹腔内静脉压力增高、直肠下端及肛管慢性感染而引起。
两者的症状也不同，肛瘘主要表现有肛周硬结，局部流脓、肛周潮湿、瘙痒、疼痛、排便不畅等。而痔疮的主要表现是大便以后出血、脱出、瘙痒，便秘等。
因此是完全不同的两种疾病。
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