食管间质瘤只是间质瘤的一种，最常见的间质瘤发生在胃或胰腺，所说的间质就是在胃和食管的粘膜、粘膜下间质组织后发生的病变。对于胃的间质瘤，病人表现为局部的肿块，甚至有出血。食管的间质瘤是发生在食管的粘膜、粘膜下组织，病人表现为进行性的吞咽困难，甚至有局部的出血、疼痛。
食管间质瘤只是胃肠道间质瘤的一种特殊表现，胃的食管间质瘤的特点是比较少见、治疗麻烦。治疗主要以手术为主，其次才考虑口服药物治疗，胃肠道间质瘤药物使用伊马替尼，通过治疗对食管的间质瘤起到控制。
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